5'-O-(4,4'-ジメトキシトリチル)-N4-ベンゾイル-2'-デオキシ-5-メチルシチジン-3'-O-(O-2-シアノエチル-N,N-ジイソプロピルアミノ) ホスホロミダイト

5'-O-(4,4'-ジメトキシトリチル)-N4-ベンゾイル-2'-デオキシ-5-メチルシチジン-3'-O-(O-2-シアノエチル-N,N-ジイソプロピルアミノ) ホスホルアミダイトは、合成 DNA およびアンチセンス オリゴヌクレオチドに 5-メチル-2'-デオキシシチジン残基を導入するための標準モノマーです。 N4-ベンゾイル基はシトシン塩基の環外アミンを保護し、固相合成中の分岐反応を防ぎます。シトシン環上の 5-メチル基は、相補的な DNA または RNA で形成される二本鎖の熱安定性を高めます (修飾あたり ΔTm ≈ +0.5 ～ 1.0 °C)。そして重要なことに、アンチセンスまたは CpG ベースのワクチンで使用された場合、CpG モチーフの免疫刺激能が低下します。 5'-O-(4,4'-ジメトキシトリチル)-N4-ベンゾイル-2'-デオキシ-5-メチルシチジン-3'-O-(O-2-シアノエチル-N,N-ジイソプロピルアミノ) ホスホルアミダイトは、標準的な DNA 合成サイクル (カップリング時間 2 ～ 3 分、テトラゾールや DCI などの活性化剤) および標準的な脱保護条件に完全に適合します。 (濃NH3、55℃、8～16時間)。 5'-O-(4,4'-ジメトキシトリチル)-N4-ベンゾイル-2'-デオキシ-5-メチルシチジン-3'-O-(O-2-シアノエチル-N,N-ジイソプロピルアミノ) ホスホルアミダイトは、他の修飾モノマーと組み合わせた場合、ロックされた核酸 (LNA) 含有オリゴヌクレオチドの合成における重要な中間体でもあります。このホスホラミダイトは、FDA 承認のアンチセンス薬の製造や、エピジェネティックな制御や DNA メチル化解析を探る研究用途で頻繁に使用されています。

製品パラメータ

Cosperpharm の品質保証

各バッチでは次の処理が行われます。

● ガスクロマトグラフィー (GC) – 純度 ≥97.0%

● 非水滴定 – 純度 ≥97.0%

● 屈折率 – 確認分析

● ¹H NMR – 構造検証

● 外観 – 無色～淡黄色～淡オレンジ色の透明液体

すべての出荷には、包括的な COA、MSDS (完全な GHS 情報を含む)、および原産地証明書が付属します。

保管条件

5'-O-(4,4'-ジメトキシトリチル)-N4-ベンゾイル-2'-デオキシ-5-メチルシチジン-3'-O-(O-2-シアノエチル-N,N-ジイソプロピルアミノ) ホスホルアミダイトは、密閉容器に入れ、不活性雰囲気 (窒素またはアルゴン) 下、-20°C で長期保存してください。乾燥下、2 ～ 8°C での短期保管 (最長 3 か月) は許容される場合がありますが、長期間の保管は推奨されません。容器を乾燥した状態に保ち、光から保護し、強い酸化剤や酸から遠ざけてください。この化合物は湿気に非常に敏感です。無水条件 (グローブボックスまたはアルゴンパージ) でのみ開けてください。開封後は、未使用の材料をアルゴン雰囲気下で -20°C に戻してください。

保存寿命: 乾燥剤を入れ、不活性パージした密閉容器内で –20°C で保管した場合、2 ～ 3 年。

取り扱い上の注意：ドラフト内で使用してください。ニトリル手袋、安全メガネ、白衣を着用してください。粉塵の発生を避けてください。取り扱い後は手を洗ってください。完全な安全性情報については、SDS を参照してください。

製品の利点

1. 5-メチルシトシンによる二本鎖の安定性とヌクレアーゼ耐性の強化

シトシン塩基上の 5-メチル基は、修飾ごとに DNA/DNA および DNA/RNA 二本鎖の融解温度 (Tm) を約 0.5 ～ 1.0℃上昇させます。この熱安定化は、より高い結合親和性が効力の向上と必要な用量の削減につながるアンチセンス オリゴヌクレオチドにおいて特に有益です。メチル基はまた、特定のヌクレアーゼに対する耐性を高めます。

2. CpGモチーフの免疫刺激の減少

非メチル化 CpG ジヌクレオチドは、ヒト免疫細胞の Toll 様受容体 9 (TLR9​​) によって認識され、望ましくない免疫刺激効果を引き起こします。 5-メチルシトシンを CpG モチーフに組み込むと (CpG を 5-meCpG に変換)、TLR9 認識が除去され、アンチセンスおよび siRNA アプリケーションにおけるオフターゲットのサイトカイン放出が減少します。 5'-O-(4,4'-ジメトキシトリチル)-N4-ベンゾイル-2'-デオキシ-5-メチルシチジン-3'-O-(O-2-シアノエチル-N,N-ジイソプロピルアミノ) ホスホルアミダイトは、この重要な免疫調節を可能にします。

3. 標準的な DNA 合成および脱保護との完全な互換性

5'-O-(4,4'-ジメトキシトリチル)-N4-ベンゾイル-2'-デオキシ-5-メチルシチジン-3'-O-(O-2-シアノエチル-N,N-ジイソプロピルアミノ) ホスホアミダイトは、標準的な 2'-デオキシシチジン ホスホラミダイトと同じ保護基スキームを使用します (5' に DMT、N4 に Bz、CE に3')、唯一の違いは 5-メチル置換基です。したがって、合成サイクル、活性化剤溶液、または脱保護条件を変更する必要はありません。すべての標準的な DNA シンセサイザーでシームレスに動作します。

4. CpG アイランドのメチル化研究に不可欠

エピジェネティック研究では、定義された 5-メチルシトシン パターンを持つオリゴヌクレオチドが、メチルトランスフェラーゼの基質として、亜硫酸水素塩配列決定の標準として、およびメチル結合タンパク質のプローブとして使用されます。 5'-O-(4,4'-ジメトキシトリチル)-N4-ベンゾイル-2'-デオキシ-5-メチルシチジン-3'-O-(O-2-シアノエチル-N,N-ジイソプロピルアミノ) ホスホルアミダイトを使用すると、研究者は酵素メチル化を行わずにカスタムメチル化 DNA 配列を合成できますが、これにより不完全または不均一なパターンが生成されることがよくあります。

5. アンチセンスオリゴヌクレオチド治療薬

FDA によって承認されたいくつかのアンチセンス医薬品（nusinersen、inotersen など）には、安定性を高め、免疫原性を低下させるために 5-メチルシトシン残基が組み込まれています。 5'-O-(4,4'-ジメトキシトリチル)-N4-ベンゾイル-2'-デオキシ-5-メチルシチジン-3'-O-(O-2-シアノエチル-N,N-ジイソプロピルアミノ)ホスホルアミダイトは、このような治療薬を商業規模で製造するために選択されるモノマーです。

お問い合わせ

5'-O-(4,4'-ジメトキシトリチル)-N4-ベンゾイル-2'-デオキシ-5-メチルシチジン-3'-O-(O-2-シアノエチル-N,N-ジイソプロピルミノ) ホスホルアミダイトの信頼できるサプライヤーをお探しですか? Cosperpharm は、高品質の製品、包括的なドキュメント、迅速な技術サポートを提供する準備ができています。