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Boc-Gly-Gly-OH (N-(tert-ブトキシカルボニル)グリシルグリシン) は、N 末端アミノ官能基を保護する tert-ブチルオキシカルボニル (Boc) 基を備え、アミド結合で連結された 2 つのグリシン残基からなる Boc 保護ジペプチドです。分子式はC9H16N2O5であり、分子量は232.23g/molである。この構造は、複雑なペプチド構築プロセス中にグリシン残基を保護する役割を果たす tert-ブチルオキシカルボニル基を特徴としています。

Boc-L-Homophe-OH (N-Boc-L-ホモフェニルアラニン) は、α-アミノ官能基を保護する tert-ブチルオキシカルボニル (Boc) 基とホモフェニルアラニン側鎖 (α-炭素から伸びるフェニルプロピル基) を特徴とする Boc 保護非天然アミノ酸です。分子式はC15H21NO4であり、分子量は279.33g/molである。 Boc 基の存在により、アミノ基は幅広い反応条件下で不活性となり、カルボン酸末端または分子内の他の場所での選択的操作が可能になります。

Boc-Asn-OH (Nα-(tert-ブトキシカルボニル)-L-アスパラギン、CAS 7536-55-2) は、天然アミノ酸 L-アスパラギンの Boc 保護誘導体です。この分子は、α-アミノ基に結合した tert-ブチルオキシカルボニル (Boc) 保護基を特徴としており、ペプチド合成中にアミン官能基を保護しながら、選択的変換に利用できるカルボキシル基と側鎖カルボキサミドを残します。

Boc-D-Leu-OH・H₂O (N-Boc-D-ロイシン一水和物、CAS 16937-99-8) は、必須アミノ酸ロイシンの非天然 D-鏡像異性体の N-Boc 保護された一水和結晶形です。この分子は、D-ロイシンのα-アミノ基に結合したtert-ブチルオキシカルボニル（Boc）保護基を特徴としており、カップリング反応のために遊離カルボン酸を保存しながら、ペプチド合成中にアミンを保護します。

Boc-メチオニンチオール アセテート (CAS 139429-04-2) は、チオアセテート官能基を特徴とする特殊な Boc 保護アミノ酸誘導体です。この分子にはアミノ部分に tert-ブチルオキシカルボニル (Boc) 保護基が組み込まれており、アセチル化されてチオ酢酸 (S-アセチル) 誘導体を形成するメチオニン由来のチオール骨格と結合しています。

Boc-Ala-OH (N-(tert-ブトキシカルボニル)-L-アラニン) は、L-アラニンのα-アミノ基に結合した tert-ブチルオキシカルボニル (Boc) 保護基を特徴とする Boc 保護アミノ酸誘導体です。この分子は、アミノ基（カルバメートとして保護）、カルボン酸、およびメチル側鎖を持つ中心のキラル炭素で構成されており、これが最も単純なキラルアミノ酸足場です。