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Fmoc-Dab(Boc)-OH (N-[(9H-フルオレン-9-イルメトキシ)カルボニル]-N’-tert-ブトキシカルボニル-L-2,4-ジアミノ酪酸) は、非タンパク質生成性アミノ酸 L-2,4-ジアミノ酪酸 (Dab) の直交保護された誘導体です。この構造は、α-アミンを保護する塩基不安定性 9-フルオレニルメチルオキシカルボニル (Fmoc) 基と、γ-アミン側鎖を保護する酸不安定性 tert-ブトキシカルボニル (Boc) 基で構成されます。この直交保護スキーム (α-アミンの Fmoc と γ-アミンの Boc) により、単一のアミノ酸ビルディング ブロック内の 2 つの異なるアミン位置の選択的で連続的な脱保護と官能化が可能になります。

Fmoc-Thi-OH は、側鎖としてチオフェン複素環を特徴とする Fmoc 保護された非天然アミノ酸です。構造的には、この分子は、α-アミノ官能基を保護するフルオレニルメチルオキシカルボニル (Fmoc) 基、中央のアラニン由来のキラル中心、および β 位の 2-チエニル基で構成されています。チオフェン環は、フェニルアラニン ベンゼン環の硫黄含有芳香族生物学的等価体として機能し、同様の電子特性を提供しますが、異なる分極性と水素結合特性を備えています。

Fmoc-Asn(Trt)-OH は、固相ペプチド合成用に特別に設計された、完全に保護された L-アスパラギン誘導体です。 α-アミノ基は鎖伸長制御のために Fmoc 基で保護されていますが、アスパラギンのアミド側鎖はトリチル (トリフェニルメチル、Trt) 基で保護されています。アスパラギンの非置換側鎖アミドは、ペプチド構築中にシアノアラニンへの脱水などの望ましくない副反応を受ける可能性があるため、この直交保護戦略はアスパラギンにとって重要です。

Fmoc-Tle-OH は、α-炭素位のかさ高い tert-ブチル側鎖を特徴とする非タンパク質生成性アミノ酸である L-tert-ロイシンの N-Fmoc 保護誘導体です。 tert-ブチル基 (-C(CH₃)₃) は、α-炭素の周囲に重大な立体障害を課し、ペプチド配列に組み込む際に例外的な立体配座制限を与える非常に密集したキラル中心を形成します。

Fmoc-Ser(PO(OBzl)OH)-OH は、リン酸部分のベンジル (OBzl) 基で保護されたリン酸化側鎖を特徴とする Fmoc 保護 L-セリン誘導体です。構造的には、この分子は、固相ペプチド合成 (SPPS) の標準的な塩基不安定性保護基である 9-フルオレニルメトキシカルボニル (Fmoc) 基で保護された一級アミンを持つ L-セリン コアと、リン酸エステルに変換されベンジル基で保護されたセリン側鎖ヒドロキシル基で構成されています。

Fmoc-Chg-OH は、L-シクロヘキシルグリシン (L-Chg-OH) の N-Fmoc 保護誘導体です。L-シクロヘキシルグリシン (L-Chg-OH) は、α-炭素位のかさばる疎水性シクロヘキシル側鎖を特徴とする非天然アミノ酸です。 L-tert-ロイシンの直鎖状 tert-ブチル基とは異なり、シクロヘキシル環は、ペプチド配列に組み込む際に明確な立体的および立体的制約を課す、剛直な飽和6員脂環式骨格を導入します。